تستند الهيئة العلمية والإشراف البحثي إلى خبرات أكاديمية ومؤسسية تُسهم في ترسيخ توجه المؤسسة نحو بحث رصين، قائم على الوثيقة، والتحقق، وصيانة الذاكرة التاريخية. ومن خلال تعدد اختصاصات أعضائها ومواقعهم العلمية والمؤسسية، تواكب الهيئة مشاريع التوثيق والنشر والإتاحة الرقمية، وتدعم بناء فضاء معرفي يخدم الباحثين والمهتمين بتاريخ المغرب وشماله.